博士班
本所博士班修業年限2-7年，最低畢業學分為32學分，含必修14學分，選修6學分(需有4學分為本所開之學分，另2學分需經學校認定，同意博士班學生選修之課程或相當博士課程以上)，博士論文學分12學分，畢業後授予醫學博士學位。
- 未具中醫師證書之研究生，須於一年級上學期選修由中醫學院開立之中醫基礎課程2學分（不認列為畢業學分）。
- 101學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 102學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 103學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 104學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 105學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 106學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 107學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 108學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 109學年度畢業學分認定表：必修、選修
- 110學年度畢業學分認定表：必修、選修
專題討論規定
- 請假次數不得多於3次
- 請於報告前務必先與指導教授討論報告內容。
- 於報告前一週繳交指導教授已確認之報告大綱，並於報告後二週內繳交書面報告。
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中西醫結合研究所中西醫學專題研究/中西醫結合專題討論書面報告格式（doc、odt）
中西醫結合研究所中西醫學專題研究/中西醫結合專題討論規定要點
英文畢業門檻認定方式（達到其中一項即可）
- 達到校外英文檢定考試標準（入學前2年內可採計）（提供證明至所辦公室）
- 使用校內配套措施，修習非同步網路英文課程滿（碩士班36hr/博士班72hr），並通過該課程內容各單元測驗（至學校 語文中心電腦教室聽課）＊博士班需資持資格考通過證明才可開始聽課
優秀大學生修讀碩博士班課程辦法
- 為鼓勵本校大學部優秀學生繼續就讀本校中西醫結合研究所碩士班，以期達到連續學習及縮短修業年限之目的，特依「中國醫藥大學獎勵優秀大學生修讀碩博士班課程辦法」規定辦理。
- 申請資格：凡本校大學部中醫學系、學士後中醫學系、醫學系、牙醫學系學生於2年級以上（4年制以上學系得於1-4年級下學期），其歷年學業成績總平均佔全系（班）前50％或曾通過「科技部大專學生研究計畫」補助者，得於本校規定申請期限內提出申請。
- 申請時間：應於本校指定日期前向研究生事務處提出申請。
- 申請表：下載